Des audits réguliers sur tous les sites de production des entreprises titulaires de la marque NF permettent de vérifier le bon fonctionnement conformément au règlement de certification. On distingue les audits techniques concernant la conformité permanente des produits certifiés, les audits qualité concernant le système qualité de l'entreprise, et les audits environnementaux concernant le management environnemental. Ces audits de surveillance sont aussi déployés sur les sites des sous-traitants principaux.